COVID-19, известный с начала 2019 года, продолжает мутировать, производя многочисленные штаммы вируса SARS-CoV-2. Болезнь, вызванную различными штаммами, обсуждают медики и общественность, поскольку она вызывает много вопросов. Мы ответим на наиболее важные вопросы, связанные с генетическими вариантами коронавируса.

В микробиологии термин "штаммы" используется для описания культур, полученных из одного и того же источника и в одном месте в одно и то же время. Однако культуры, полученные из того же источника, но в разное время, могут иметь разные штаммы. Хотя микроорганизмы разных штаммов могут принадлежать к одному виду, они различаются между собой. Внутривидовые различия несущественны.

Как пример можно привести коронавирус. Вирус SARS-CoV-2 - виновник последней пандемии COVID-19 - является одним из многих коронавирусов. За время пандемии образовалось несколько штаммов SARS-CoV-2. Эти штаммы различаются между собой геномом, то есть набором генов.

Важно отметить, что вирусы, в том числе и SARS-CoV-2, не являются клетками, а являются носителями генетической информации. Они имеют особую структуру - вирусная частица окружена капсулой и внешней оболочкой, а внутри капсулы находится одна или две молекулы нуклеиновой кислоты. Коронавирус является одноцепочечным РНК-содержащим. Его геном закодирован в единственной молекулярной цепи рибонуклеиновой кислоты.

Штаммы образуются в результате генных мутаций, когда дочерние вирусы немного отличаются от родительских по генетическим характеристикам. Штаммы коронавируса отличаются друг от друга по скорости распространения и клиническим проявлениям инфекционного заболевания. Благодаря генетической изменчивости коронавируса образуется устойчивость к иммунной системе и медикаментозным препаратам.

В данной статье мы ответили на основные вопросы, связанные со штаммами коронавируса, их опасностью и мерами предосторожности.

Известно уже множество штаммов коронавируса SARS-Cov-2, каждый из них обозначается отдельной буквой греческого алфавита в соответствии с классификацией Всемирной организации здравоохранения. Первоначально штаммы ассоциировались с той страной, в которой они были обнаружены впервые. Например, британский штамм коронавируса был впервые выявлен в Великобритании и получил название "альфа", южноафриканский стал известен как "бета", бразильский - как "гамма", а индийский - как "дельта".

Однако географическая привязка к странам в названии штаммов может вызывать негативную реакцию и включать в обвинения в распространении COVID-19 целые страны. Поэтому ВОЗ предложила новую номенклатурную классификацию, основанную на греческом алфавите. Это не мешает использованию старых названий в медицинских исследованиях.

Но даже в новой классификации есть некоторые нюансы. Штамм коронавируса "омикрон" также получил название греческой буквы. Первоначально, перед ней должны были стоять буквы "ню" и "кси", однако их пропустили. Это связано со страхом вызвать панику у жителей англоязычных стран, если бы штамм назвали "новым", и с антикитайскими настроениями, связанными с ассоциацией буквы "кси" с китайской фамилией Си, которая носит лидер этой страны Си Цзиньпинь.

На начало 2022 года количество штаммов коронавируса, которые отличаются от первоначального, китайского варианта, составляет уже 13.

Вирусные штаммы COVID-19, которые считаются опасными, обладают определенными критериями. Во-первых, они характеризуются высокой контагиозностью, что означает их легкую передачу от человека к человеку. Во-вторых, это вирулентные штаммы, способные вызывать патологические изменения в тканях организма. Кроме того, они приводят к тяжелому течению инфекции, что сопровождается высокой вероятностью осложнений и неблагоприятного исхода болезни. Наконец, опасные штаммы коронавируса устойчивы к действию вакцин и лекарств. Все эти критерии использовались ВОЗ при разработке списка штаммов, вызывающих опасения, – VOC (Variants of Concern). В этот список вошли несколько штаммов, включая альфа-, бета-, гамма- и дельта-штаммы коронавируса. А 26 ноября 2021 года ВОЗ дополнила список новым штаммом омикрон. Также был разработан список генетических вариантов, вызывающих интерес – VOI (Variants of Interest). Если уровень заболеваемости этими вариантами возрастет, то их переведут в категорию VOC. В список VOI в 2021 году вошли несколько штаммов: эта-, йота-, каппа- и лямбда-штаммы.

Как проявляется COVID-19, вызванный дельта-штаммом, и в чем его отличие от классического коронавируса?

Дельта-штамм коронавируса, выявленный в Индии, имеет более короткий минимальный инкубационный период, чем классический коронавирус, изначально обнаруженный в городе Ухань. Максимальный период инкубации по-прежнему составляет две недели.

Помимо стандартных симптомов COVID-19, таких как кашель, лихорадка, потеря обоняния и вкуса, дельта-штамм вызывает симптомы, характерные для расстройства желудочно-кишечного тракта, такие как тошнота, рвота и диарея. При этом встречаются боли в голове и горле. Самой уязвимой группой при заражении дельта-штаммом является молодежь в возрасте от 14 до 29 лет.

Источник: Роспотребнадзор. 2021. "Дюжина вопросов о «дельта»-штамме". Доступно по ссылке.

Какова опасность дельта-штамма коронавируса?

Новая индийская вариация коронавируса отличается от классической своей высокой инфекционной способностью. Если в случае COVID-19 каждый пациент заражал от 2 до 3 человек, то в случае дельта-штамма этот показатель возрастает до 5-8. Привнесла ли новая форма изменения в клинический характер заболевания? Индивидуальные особенности клинического течения могут играть роль в увеличении количества заражений. Так, высокая температура часто предупреждает о заражении, но в случае дельта-штамма этот симптом может проявиться не сразу, что делает труднее обнаружить источник инфекции.

Количество вирусов в организме с штаммом дельта-плюс значительно выше по сравнению с классическим COVID-19, поэтому выработка антител требует больше времени и усилий. Усложняется лечение и резко растет вероятность госпитализации пациента. Штамм дельта плюс коронавируса, который является новой модификацией, особенно тяжело протекает и грозит значительным угрозам.

Что отличает британский вариант коронавируса от SARS-CoV-2?

Сравнительно с классическим китайским вариантом, симптомы британской коронавирусной инфекции проявляются чаще и с большей степенью выраженности. Например, боль в горле и кашель чаще отмечаются при альфа-штамме. Но утрата обоняния происходит реже - только у 39% пациентов.

Кроме того, вирус на 90% более заразен, а болезнь протекает более тяжело. Частота госпитализации в случае заражения альфа-штаммом выше на 64%, повышая риск неблагоприятного исхода.

Но к счастью, на территории РФ уровень заболеваемости британским штаммом не так высок. В целом, хочется отметить, что на сегодняшний день выделены несколько вариантов коронавируса - альфа, бета, гамма, дельта - и они отличаются друг от друга по структуре и способности заразить человека.

Штамм омикрон: что мы о нем знаем?

В ноябре 2021 года был обнаружен еще один штамм коронавируса, происходящий из Южной Африки. Он быстро распространился по всему миру, вызывая заболеваемость у многих людей. Штамм омикрон очень заразен и ежедневно устанавливает новые рекорды по числу заболевших. В отличие от первоначального COVID-19, который преимущественно поражал пожилых людей и тех, у кого имеются сопутствующие заболевания, новый штамм также инфицирует детей.

Однако, пока нет единого мнения насчет того, насколько тяжело развивается заболевание и какова вероятность плохого исхода. Согласно лабораторным исследованиям, омикрон-штамм реже проникает в легкие, в отличие от первоначального варианта коронавируса, и чаще поражает носоглотку. Именно из этой части тела вирус проще распространяться воздушно-капельным путем, что может быть одной из причин высокой заболеваемости. В то же время, количество смертельных случаев остается на стабильно низком уровне, составляя около 0,1-0,2% от числа заболевших.

Биолог Константин Северинов дал ответы на 10 основных вопросов о штамме омикрон. Источник: https://trends.rbc.ru/.

Как определить заражение конкретным вариантом коронавируса?

Каждый штамм вируса имеет свои характеристики. Например, один генетический вариант вызывает более легкую форму болезни, а другой может приводить к более тяжелым последствиям. Некоторые штаммы относятся к возрастным категориям, одни поражают пожилых людей, в то время как другие — всех возрастов.

Хотя различия в штаммах могут определяться поражением легких, носоглотки или желудочно-кишечного тракта, не следует полагаться на эти особенности.

Чтобы точно определить генетический вариант SARS-CoV-2, необходима объективная диагностика, такая как полимеразная цепная реакция (ПЦР) методом секвенирования. При этом изучают последовательность генов в молекулярной цепи. Хотя для проведения ПЦР необходимо сложное оборудование, процедура является довольно простой: мазок берется из носоглотки и ротоглотки. И это можно сделать как в условиях медицинского центра, так и на дому. Результат будет доступен уже через несколько часов, а их достоверность приблизительно равна абсолютной. Поэтому ПЦР признается "золотым стандартом" диагностики COVID-19.

Существует первая отечественная тест-система для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2. Детальнее о ней можно прочитать на информационном портале о генетике GENETICS. URL: https://genetics-info.ru/.

Вопрос о том, сохраняется ли иммунитет у человека после перенесенного коронавируса к другим его штаммам, остается открытым. После первого заражения в крови образуются антитела, которые пытаются уничтожить новые заражения. Однако возможно, что мутировавший коронавирус может плохо связываться с антителами, поэтому иммунная система может уничтожать не все, а лишь некоторые штаммы вируса.

Кроме того, временной фактор тоже имеет огромное значение. Со временем количество циркулирующих антител в крови уменьшается. Это означает, что эффективность защиты от последующих инфекций также может быть разной, в зависимости от времени, когда повторное заражение произошло, состояния иммунитета и вида мутации. В общем, ответ на вопрос о том, сохраняется ли иммунитет после перенесенного коронавируса, не является однозначным.

Фото: freepik.com